Differenze nel microbioma intestinale dei vitelli Hanwoo (bestiame indigeno coreano) in seguito a infezione da rotavirus bovino e coronavirus bovino

Lo studio rappresenta una ricerca trasversale comparativa sul microbioma intestinale di vitelli Hanwoo, una razza bovina indigena coreana di notevole importanza economica. Il disegno sperimentale prevedeva il reclutamento di due gruppi ben definiti: sette vitelli sani come controllo negativo e otto vitelli con diarrea clinicamente manifesta come gruppo sperimentale. Da entrambi i gruppi sono stati raccolti campioni fecali per effettuare analisi virologiche e caratterizzazione del microbioma attraverso sequenziamento metagenomico. La metodologia ha permesso di identificare simultaneamente i patogeni virali presenti e le alterazioni della composizione microbica correlate. I risultati principali evidenziano che mentre non si osservavano differenze significative nella diversità alfa (indici di NPShannon e Shannon) tra i gruppi, l'infezione da BRV causava una diminuzione maggiore di questi indici rispetto a BCoV, con conseguente aumento dell'indice di Simpson. L'analisi della diversità beta ha rivelato clustering distinti tra vitelli normali e infetti. A livello tassonomico, BRV ha incrementato le abbondanze relative di Gammaproteobacteria e Actinobacteria, mentre BCoV ha favorito Clostridia riducendo Bacilli. Particolarmente rilevante è la riduzione significativa di Lactobacillus, bacteria benefica produttrice di acido lattico, in entrambi i gruppi di vitelli infetti. Questo fenomeno è clinicamente significativo poiché Lactobacillus svolge funzioni critiche nella barriera intestinale e nella modulazione immune locale. Il contesto clinico è importante perché la diarrea neonatale nei vitelli comporta elevate perdite economiche e compromissione della crescita, mentre il microbioma intestinale in sviluppo è particolarmente vulnerabile alle perturbazioni patogene.