Sequenza del genoma in bozza di Enterobacter cloacae ceppo TG-C5.2 isolato da acque di acquacoltura di gamberi nel Delta del Mekong, Vietnam

Lo studio rappresenta un contributo importante nel campo della genomica batterica applicata alla sorveglianza antimicrobica negli ambienti acquatici. Enterobacter cloacae è un batterio opportunista gram-negativo appartenente alla famiglia Enterobacteriaceae, noto per la sua capacità di colonizzare diversi ambienti e di acquisire facilmente geni di resistenza attraverso meccanismi di trasferimento genico orizzontale. L'isolamento da acque di acquacoltura è particolarmente significativo poiché questi ambienti rappresentano hotspot per l'accumulo e la selezione di batteri multiresistenti, specialmente in regioni dove il controllo normativo sull'uso di antibiotici veterinari è meno stringente. Il gene blaCTX-M-15 è una beta-lattamasi a spettro esteso (ESBL) di importanza clinica globale, responsabile della resistenza alle cefalosporine di terza generazione, antibiotici di scelta per molte infezioni gravi. La metodologia di sequenziamento genomico consente di identificare non solo i geni di resistenza noti, ma anche di scoprire elementi genetici mobili quali plasmidi e trasposoni che facilitano la diffusione di questi geni. Nel contesto dell'acquacoltura nel Delta del Mekong, una delle regioni con maggiore produzione ittica mondiale, l'identificazione di ceppi multiresistenti in acque di allevamento pone importanti interrogativi sulla trasmissione di batteri resistenti attraverso la catena alimentare e l'ambiente. La caratterizzazione completa del genoma permette comparazioni filogenetiche con altri ceppi di E. cloacae, contribuendo alla comprensione dell'evoluzione e della dispersione geografica di questo patogeno. I risultati di questo studio si inseriscono in un panorama più ampio di crescente consapevolezza sulla resistenza antimicrobica come minaccia globale, particolarmente rilevante nei paesi in via di sviluppo dove il carico di malattie infettive è elevato.