Il panorama trascriptomico del cancro della colecisti rivela alterazioni nelle vie del ciclo cellulare e della chinasi Aurora

Il carcinoma della colecisti è una neoplasia maligna rara ma caratterizzata da aggressività biologica e prognosi generalmente sfavorevole, rappresentando una sfida clinica significativa in oncologia. Questo studio impiega un approccio genomico comprehensivo combinando RNA sequencing (RNA-seq), analisi di arricchimento funzionale (FEA) e weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) per decriptare i meccanismi patogenetici sottostanti. Il disegno sperimentale include 13 campioni tumorali con 6 controlli abbinati, permettendo identificazione robusta di geni espressi differenzialmente (DEGs). I risultati quantitativi mostrano 1.319 DEGs totali: 528 upregolati e 791 downregolati, con una proporzione favorevole ai geni soppressi. L'analisi di arricchimento genico rivela attivazione di pathway critici quali bersagli E2F e checkpoint G2/M, elementi canonici della progressione neoplastica, mentre evidenzia simultaneous downregulation di vie metaboliche endogene (metabolismo degli acidi biliari) e di vie mediate da estrogeni, suggerendo un'alterazione profonda dell'omeostasi cellulare. La WGCNA ha identificato moduli genici correlati al grado tumorale, con TPX2 (targeting protein for Xklp2) emergente come hub gene centrale nella co-espressione. TPX2 è proteina nucleare critica per la regolazione della mitosi e dell'organizzazione del fuso mitotico, con espressione frequentemente elevata in neoplasie ad alto grado. La validazione funzionale mediante inibitori della chinasi Aurora dimostra riduzione significativa di proliferazione, migrazione e invasività cellulare, sottolineando il ruolo causale di questi enzimi nella biologia tumorale. Questo studio rappresenta il primo profilaggio trascriptomico sistematico di GBC in una coorte sud-asiatica indiana, popolazione con particolare incidenza di patologie biliari, colmando un vuoto nella caratterizzazione molecolare di questa popolazione. I risultati integrano metodologie omiche avanzate con validazione biologica sperimentale, fornendo biomarcatori potenziali e identificando Aurora kinase come bersaglio terapeutico promettente.